Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxraP28700 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxraP28700 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RxraP28700 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RxraP28700 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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