Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms