Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2afxP27661 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms