Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccnd1P25322 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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