Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd247P24161 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms