Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms