Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Eif3aP23116 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms