Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gna11P21278 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gna11P21278 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gna11P21278 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms