Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc2P20801 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc2P20801 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms