Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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