Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RargP18911 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RargP18911 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RargP18911 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms