Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt1P13864 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms