Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rb1P13405 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rb1P13405 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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