Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spp1P10923 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms