Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P10404 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P10404 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P10404 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
P10404 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P10404 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P10404 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P10404 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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P10404 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P10404 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P10404 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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