Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms