Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefmP08553 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefmP08553 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefmP08553 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefmP08553 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms