Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms