Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtrP07309 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TtrP07309 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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