Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06321 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06321 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P06321 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P06321 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06321 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06321 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06321 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06321 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06321 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06321 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06321 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06321 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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