Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01648 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01648 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01648 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms