Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccl20O89093 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccl20O89093 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ccl20O89093 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl20O89093 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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