Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc6O88978 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms