Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CcnkO88874 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CcnkO88874 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CcnkO88874 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CcnkO88874 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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CcnkO88874 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CcnkO88874 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnkO88874 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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