Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms