Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3bO88509 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms