Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3aO88508 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms