Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Kcnk4O88454 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Kcnk4O88454 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnk4O88454 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnk4O88454 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Kcnk4O88454 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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