Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms