Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms