Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm10509O88255 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Gm10509O88255 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm10509O88255 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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