Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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