Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtssO70370 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtssO70370 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtssO70370 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtssO70370 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtssO70370 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms