Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgceO70258 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgceO70258 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgceO70258 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgceO70258 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgceO70258 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms