Protein–RNA interactions for Protein: O55137

Acot1, Acyl-coenzyme A thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot1O55137 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Acot1O55137 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Acot1O55137 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Acot1O55137 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acot1O55137 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Acot1O55137 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms