Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copb2O55029 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms