Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb3O54890 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms