Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChkaO54804 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChkaO54804 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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