Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DffaO54786 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DffaO54786 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DffaO54786 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DffaO54786 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DffaO54786 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DffaO54786 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffaO54786 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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DffaO54786 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffaO54786 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffaO54786 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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