Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms