Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CrxO54751 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrxO54751 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms