Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc1a6O35544 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc1a6O35544 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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