Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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