Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms