Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dgcr6O35347 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dgcr6O35347 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms