Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2O35245 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2O35245 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms