Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bhlhe40O35185 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Bhlhe40O35185 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bhlhe40O35185 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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