Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nedd9O35177 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nedd9O35177 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nedd9O35177 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nedd9O35177 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd9O35177 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nedd9O35177 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd9O35177 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms