Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms