Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ArxO35085 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ArxO35085 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms